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凈化工程
基因擴增實驗又稱PCR實驗,其特點是能將微量的DNA大幅增加,PCR是分子生物學研究和實驗的常規(guī)方法,廣泛應用于生物學各個領(lǐng)域,例如:艾滋病檢測、乙型肝炎、禽疫病、癌基因的檢測和診斷,DNA指紋、個體識別、親子鑒定及法醫(yī)物證,動、植物檢疫,動物及其衍生產(chǎn)品檢測,動物飼料、化妝品、食品衛(wèi)生檢測,轉(zhuǎn)基因作物與轉(zhuǎn)基因微生物檢測等。pcr實驗室有效避免在實驗過程中造成試劑、標本、擴增物以及操作人員的交叉污染,保證人員安全及實驗數(shù)據(jù)可靠。
一、PCR基因擴增實驗室必須擁有的條件:
1、必須在無菌無塵環(huán)境下進行操作;
2、檢測人員必須通過國家臨檢中心業(yè)務培訓并取得合格證書;
3、必須通過國家臨床檢驗中心的驗收和認證;
4、檢測設備必須符合標準PCR熒光實驗室設置要求;
5、必須擁有標準的的PCR熒光實驗室;
二、PCR基因擴增實驗室建立辦法流程:
1、建立樣品準備區(qū);
2、樣品準備和RNA-PCR RNA-PCR的額外步驟需要額外的樣品操作,這樣增加了樣品之間污染的機會。為了避免這一問題,反轉(zhuǎn)錄一步可以在樣品準備區(qū)進行。在RNA-PCR中應用UNG以防止污染的方法也有報道;
3、建立前PCR區(qū);
4、PCR實驗室試劑的操作;
5、在前PCR區(qū)建立PCR混合物;
6、控制污染的方法;
7、后PCR區(qū)PCR完成以后,需要分析樣品并解釋數(shù)據(jù),應該留出一個專門用于反應后處理樣品的地方;
三、PCR實驗室布局
要完成一組pcr實驗,通常需要經(jīng)過試劑配制、樣品處理、核酸擴增和產(chǎn)物分析4個實驗過程。這4個實驗過程的實驗用房應相鄰布置,組成一個獨立的pcr實驗區(qū)。標準的pcr實驗區(qū)包括:試劑準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū)、各區(qū)配套的緩沖區(qū)及公共走廊。
1.試劑準備區(qū)
該實驗區(qū)主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于標本制作的材料應直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。
試劑準備區(qū)配備有2~8°C冰箱和-80°C冰箱,計算冷負荷時,需要將它們計算在內(nèi)。
房間的面積宜控制在15㎡~20㎡。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對正壓狀態(tài),以防止外界含核酸氣溶膠的空氣進入,造成污染。
2.標本制備區(qū)
該區(qū)域主要進行的操作為臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時cDNA的合成。標本制備區(qū)配備有2~8°C冰箱和-20°C冰箱,計算冷負荷時,需要將它們計算在內(nèi)。在標本制備區(qū),還需要配備生物安全柜,用于進行提取核酸的操作。
為避免提取的核酸在柜內(nèi)反復循環(huán),造成標本之間的交叉污染,出現(xiàn)假陽性結(jié)果,該區(qū)域配備的生物安全柜必須是B2型的。生物安全柜工作區(qū)垂直氣流全部來自實驗室,排風經(jīng)過高效過濾器過濾后直接排至室外,不允許回到安全柜和實驗室中。
根據(jù)經(jīng)驗,如果實驗室內(nèi)配備生物安全柜,每配備一臺,實驗室的面積增加10m2;標本制備區(qū)的面積宜在25㎡~30㎡之間。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。
3.擴增室
該區(qū)域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本制備區(qū))的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進 行。
在巢式PCR測定中,通常在第一輪擴增后必須打開反應管,因此巢式擴增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區(qū)內(nèi)進行。
擴增室主要配備PCR實驗室的核心儀器PCR儀,在實驗室建造過程中,需要給PCR儀配備專門的UPS電源,以保證其正常工作。該區(qū)面積控制在15㎡~20㎡。
本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區(qū)內(nèi)的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內(nèi)進行。建議采用 5~10Pa壓差,在控制上比較容易實現(xiàn)。
4.產(chǎn)物分析區(qū)
該區(qū)域主要進行的操作為擴增片段的測定。
在室內(nèi)配備通風櫥,保證房間內(nèi)的相對負壓,空氣從室外流向室內(nèi)。該區(qū)面積控制在15㎡~20㎡。本區(qū)是最主要的擴增產(chǎn)物污染來源,因此對本區(qū)的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免擴增產(chǎn)物從本區(qū)擴散至其它區(qū)域。建議采用5~10Pa壓差,在控制上比較容易實現(xiàn)。
5.正負壓區(qū)域緩沖室的設置
根據(jù)壓力梯度的要求,試劑配制室和樣品處理室為相對正壓,擴增室和產(chǎn)物分析室為相對負壓,要求正壓的區(qū)域和要求負壓的區(qū)域的緩沖室內(nèi)的壓力設計大不相同
四、PCR實驗室裝修裝飾
實驗室圍護結(jié)構(gòu)應牢固、氣密性好;所有陰陽角宜采用圓弧過渡;墻體內(nèi)壁光潔、不積塵、耐腐蝕、易清洗消毒;地面使用PVC卷材或環(huán)氧樹脂自流坪,材料應滿足無縫隙、無滲漏、光潔、耐腐蝕的要求。注意事項:
1、幾個區(qū)域的大小設置情況,試劑準備區(qū)、擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū),空間可以相對小一些,樣品制備區(qū)要放置生物安全柜和低溫冰箱,空間應大一些。
2、試劑準備區(qū)、樣品制備區(qū)設緊急洗眼器,以保證操作人員的安全。
3、PCR實驗室沒有嚴格的凈化要求,可以根據(jù)用戶的使用情況和資金的投入選擇。
總之PCR基因擴增實驗室,從實驗室設計,實驗室規(guī)劃到實驗室建設都是技術(shù)含量比較高的系統(tǒng)工程,需要專業(yè)公司團隊開展,否則無法達到理想效果,中晶在PCR基因擴增實驗室有著豐富的實踐經(jīng)驗,如有需要建PC實驗室及了解相關(guān),歡迎來電咨詢:13051005692(微信同號)
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